1、物理灭蛆法：（1）闷杀法：可用草灰或热灰往粪池的粪面上撒，以阻断空气来源或借热灰作用杀死蝇蛆。（2）捞杀法：把蛆捞出烫死或喂家禽，此法适用于稀粪，比较费力。（3）徇柝璎镨清掏法：及时把厕所内的粪便清掏干净，依靠堆肥发酵产生的热及有害气体，杀死粪肥中的蛆、蛹及寄生虫卵。
2、药物灭蛆法：使用常见的各种杀虫剂消杀。如敌百虫：0.5~1%敌百虫水溶液，倍硫磷：0.5%乳剂，二嗪哝(地亚农)：0.05～0.1%乳剂，灭幼脲：0.0125~0.025％悬浮剂，对厕所进行喷洒，灭蛆效果较好。
3、植物灭蛆法：苦楝树是农村常见的树木，枝繁叶茂树冠硕大，其枝叶有一定毒性，可以起到消灭蛆虫的作用，将苦楝树枝叶弄碎之后，扔到茅厕中，能够很好防治蛆虫。