南京别称有石头城、金陵、建邺、秦淮、上元等。
石头城：南京叫做石头城是因为在赤壁之战后，孙权把东吴的首都搬迁到南京了，然后还在本来就加固的防御上加固了一番，像石头一样坚硬，所以人们就把南京叫做石头城了。
金陵：金陵是南京的古称，古时候的金陵是世界上第一个拥有百万人口的城市，也是当时全球上最大的城市。
建邺：建邺是现在南京的一个区，在西晋的时候，人们把南京叫做建邺，所以现在人们称南京为建邺。
秦淮：秦淮现在是南京市秦淮区，在这个区里，有著名的夫子庙和秦淮河。
上元：上元是现在南京市的一个县，这个称呼是唐朝时期对于南京的称呼。