中国药科大学基础医学与临床药学学院于2015年12月24日在南京揭牌成立。学院成立后，将培养一批高素养的临床药学专业人才，并加强对重大疾病的病因、合理用药与精准治疗等科学问题的攻坚能力。
中国药科大学基础医学与临床药学学院由基础医学系、临床药学系、转化医学研究中心组成，下设细胞与分子生物学实验平台、药学动物实验中心、临床药学实验教学中心、江苏省肿瘤发生与干预重点实验室、病理学研究室、毒理学研究室、微生物与免疫药理学研究室、生理学教研室、临床药学教研室、临床药代动力学研究室等10个教学及科研服务平台。
学院成立后，一方面要培养高素质、高层次、国际化的临床药学专业人才，全面提高药大办学层次和质量；另一方面要着重加强对重大疾病的病因、合理用药与精准治疗等科学问题的攻坚能力，加速自主创新药物的成果转化，提升原创新药的竞争力。