主要区别有，提取不同、制作工序不同、用途不同，具体如下： 一、提取不同 1、小麦淀粉 小麦淀粉是从小麦中提取淀粉。 2、玉米淀粉 玉米淀粉是从玉米中提取淀粉。
二、制作工序不同 1、小麦淀粉 是采用发酵法，即将小麦加水浸软、磨碎后，进行加酸发酵，使包围在淀粉颗粒周围的细胞被溶解而淀粉易于分离。 2、玉米淀粉 是将玉米用0.3%亚硫酸浸渍后，通过破碎、过筛、沉淀、干燥、磨细等工序而制成。
三、用途不同 1、小麦淀粉 主要应用于食品做增稠剂、胶凝剂、黏结剂、或稳定剂等，也有的用其做淀粉糖（食用糖的一种）工业上应用不多。 2、玉米淀粉 在中国菜和法国菜里用作增稠剂。中国菜里的“勾芡”（又称芡汁），一般就是用玉米淀粉加上水制成的。