区别一：外表不同。其颜色是最能区别二者的，紫灵芝呈现褐色或近黑色；而赤灵芝主要是红褐色。
区别二：味道不同。赤灵芝味苦、性平；而紫灵芝味甘、性温。
区别三：功效不同。紫灵芝主要是用于食疗养生，而赤灵芝适合用来治病。